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實驗室內會為核酸檢測準備4個區域，分別是試劑準備區、樣本準備區、擴增區、擴增產物分析區。
其中試劑準備區負責接收患者樣本，樣本準備區則負責進行對樣本的核酸進行提取，擴增區則是擴增復制核酸樣本，擴增后分析區就是分析樣本內核酸能能否與標準樣配對，通過儀器檢測的到，就判斷成陽性，如果檢測不到就是陰性。
空間要求
核酸檢測實驗室應有保證開展工作的空間，且不影響工作質量，質量控制程序、保障人員和患者的醫護服務，應由實驗室負責人確定工作空間是否充分。
樣品要求：
如果提供了原始樣品采集實施，應在盡量優化樣品采集條件的同時，考慮患者的行動能力、舒服的和隱私。
環境要求：
核酸檢測實驗室的設計與環境應適應所從事的工作。采集和檢驗原始樣品的環境不應使結果失效或對任何測量的質量有不利影響。
